Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms