Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afap1l2Q5DTU0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms