Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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Znf608Q56A10 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Znf608Q56A10 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf608Q56A10 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Znf608Q56A10 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf608Q56A10 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms