Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms