Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc160Q3UYG1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms