Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms