Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms