Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arfgef3Q3UGY8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arfgef3Q3UGY8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms