Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms