Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms