Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prr27Q3SYJ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prr27Q3SYJ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms