Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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