Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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