Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms