Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NeblQ0II04 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms