Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms