Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms