Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gdf3Q07104 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms