Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms