Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd1Q01822 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms