Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms