Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms