Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Il6stQ00560 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms