Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlkP97793 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlkP97793 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms