Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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