Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b3P97370 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms