Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PrkdcP97313 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PrkdcP97313 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PrkdcP97313 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PrkdcP97313 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PrkdcP97313 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PrkdcP97313 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrkdcP97313 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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