Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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