Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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