Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms