Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms