Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Acta1P68134 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Acta1P68134 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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