Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl8P62918 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl8P62918 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms