Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms