Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms