Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms