Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf13P61216 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms