Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp1P59054 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms