Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Paxbp1P58501 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms