Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms