Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad23aP54726 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms