Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux1P53564 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms