Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms