Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms