Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TubP50586 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TubP50586 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TubP50586 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms