Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms