Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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