Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nedd4P46935 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms