Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lig1P37913 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lig1P37913 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms