Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms